Диссертация - Определение и анализ структур агглютинина из Eicinus communis и Вискумина (ML-1) из viscum album-Белков, инактивируютцик рибосому
Содержание
ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И ОБОЗНАЧЕНИЙ 4
ВВЕДЕНИЕ 5
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 7
1.1 Каталитические А-субъедишщы белков, инактивирующих рибосому. 7
1.1.1 Структура и ферментативная активность А-субъединицы рицина. 7
1.1.2 Моделирование ингибирования каталитической активности А-субъединицы 14
1.1.3 Структура и ферментативная активность А-субъединицы абрина 20
1.1.4 Структура и ферментативная активность А-субъединицы эбулина 21
1.1.5 Рибосом-инактивирующие белки первого типа 22
1.1.5.1. Антивирусный белок лаконоса (РАР). 23
1.1.5.2. Трихосантин 27
1.1.5.3 Бриодин 33
1.1.5.4 Сапорин 33
1.2. Траспортная В-субъединица рибосом-инактивирующиех белков второго типа 3 7
1.2.1. Структура и углевод-связывающая активность В-субъединицы рицина 3 8
1.2.2. Структура и углевод-связывающая активность В-субъединицы абрина 41 1.2.3 Структура и углевод-связывающая активность В-субъединицы эбулина 41
1.3. Особенности внутриклеточного транспорта рибосом- инактивирующих белков второго типа. Роль структурных особенностей данных белков при транспорте внутри клетки 43 1.3.1 Интернетизация токсина 43
1.3.2. Транспорт в эндосомальном компартменте 43
1.3.3. Транспорт в аппарат Гольджи 44
1.3.4. Ретроградный транспорт в эндоплазматический ретикулум. 44
1.3.5. Транслокация токсина 45 ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 47
2.1. Выделение и очистка агглютинина 47
2.2. Кристаллизация агглютинина в комплексе с jS-D-галактозой 47
2.3. Сбор дифракционных данных с кристаллов агглютинина 48
2.4 Выделение вискумина из Viscum album 49
2.5 Кристаллизация вискумина и его комплексов 50
2.6 Сбор дифракционных данных с кристаллов вискумина и его комплексов 51 ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 52
3.1 Решение проблемы фаз для агглютинина 52
3.2 Определение и уточнение структуры агглютинина 55
3.3. Укладка полипептидной цепи агглютинина 56
3.4. Структура А-субъединицы агглютинина 58 3.5 Активный центр А-субъединицы агглютинина 60 3.6. Структура В-субъединицы агглютинина 62
3.7 Первый галактозо-связывающий центр агглютинина 63
3.8 Второй галактозо-связывающий центр агглютинина 65 3.9. Межсубъединичные контакты агглютинина 66
3.10 Решение проблемы фаз для вискумина 67
3.11 Определение и уточнение структуры вискумина и его комплексов 70
3.12. Структура А-субъединицы вискумина 73
3.13. Активный центр А-субъединицы вискумина 74
3.14. Структура В-субъединицы вискумина. 74
3.15. Первый галактозо - связывающий центр вискумина 75
3.16. Второй галактозо - связывающий центр вискумина 77
3.17 Взаимодействие рибосом-инактивирующих белков с сарцин-рициновой петлей рибосомы 79
3.18 Четвертичная структура агглютинина и вискумина. 84 ВЫВОДЫ 87 СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 88
